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Discovery Studio 2024,開啟你的藥物設(shè)計(jì)之旅!
新功能:
藥效團(tuán)
(1)PharmaDB Profiler協(xié)議報(bào)告每個(gè)獨(dú)特功能的映射詳細(xì)信息;
(2)PharmaDB Filter協(xié)議可以使用pdb_id或scpdb_id進(jìn)行過(guò)濾;
客戶端
核酸鏈的主鏈可以在Discovery Studio客戶端中通過(guò)殘基進(jìn)行著色;
增強(qiáng)功能:
(1)Perl腳本語(yǔ)言升級(jí)到5.36.0;
(2)通過(guò)殘基對(duì)核酸主鏈進(jìn)行著色;
(3)藥效團(tuán)理論的幫助信息現(xiàn)在包括,提供有關(guān)形狀評(píng)分和藥效團(tuán)特征特性的詳細(xì)信息;
(4)動(dòng)力學(xué)(Production)、動(dòng)力學(xué)(NAMD)、GaMD平衡和GaMD Production協(xié)議進(jìn)行了更新,包括改進(jìn)的參數(shù)驗(yàn)證,以及對(duì)時(shí)間步長(zhǎng)參數(shù)的修改,縮小選擇范圍到特定范圍內(nèi)的離散增量;
(5)提前安裝Pipeline Pilot 2024;
(6)改進(jìn)了Align Sequence Profiles(Align 123)協(xié)議中Use Secondary Structure參數(shù)的幫助文本,并在選擇DSC或TRANSMEM二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行對(duì)齊時(shí),如果沒(méi)有提供正確的二級(jí)結(jié)構(gòu)輸入,則增加了錯(cuò)誤處理信息;
(7)以下協(xié)議不能從Discovery Studio客戶端訪問(wèn):更新抗體數(shù)據(jù)庫(kù)、下載BLAST DB文件、更新BLAST數(shù)據(jù)庫(kù)、構(gòu)建PDB引用數(shù)據(jù)和自定義Discovery Studio模板。只能從Pipeline Pilot Professional客戶端訪問(wèn);
(8)Intel MPI升級(jí)到2021.10;
(9)Qt Windows庫(kù)更新到5.15.14版本,以解決安全漏洞;
(10)PharmaDB Profiler協(xié)議報(bào)告每個(gè)唯一函數(shù)的映射詳細(xì)信息,PharmaDB Filter協(xié)議支持使用pdb_id和scpdb_id進(jìn)行過(guò)濾;
修補(bǔ)功能:
(1)當(dāng)平臺(tái)參數(shù)設(shè)置為GPU時(shí),Dock Proteins(ZDOCK)協(xié)議在Windows上不再失?。?/span>
(2)從默認(rèn)值修改Tolerance參數(shù)后,Create 3D Fingerprint協(xié)議不再失敗;
(3)使用指定為快捷路徑的重新啟動(dòng)文件從Pipeline Pilot Professional客戶端運(yùn)行時(shí),Dynamics(生產(chǎn))和Dynamics(平衡)協(xié)議不再失??;
(4)分配力場(chǎng)協(xié)議不再為相應(yīng)力場(chǎng)RTF中具有兩個(gè)字母元素符號(hào)的原子生成不正確的原子排序;
(5)分配力場(chǎng)協(xié)議使用力場(chǎng)數(shù)據(jù)更新結(jié)構(gòu);
(6)Discovery Studio客戶端中的PDB Ligand Bond Orders腳本可以正常工作;
(7)如果疊加算法無(wú)法收斂,測(cè)量軌跡特征、自由能預(yù)測(cè)和簇一致性協(xié)議會(huì)產(chǎn)生錯(cuò)誤,修改原子選擇或參考構(gòu)象可以解決此錯(cuò)誤;
(8)作業(yè)描述參數(shù)將從MATCH協(xié)議的分配力字段和類型配體中刪除。這不會(huì)影響協(xié)議的功能;
(9)Predict Humanization Mutations協(xié)議將查詢序列的名稱包含在最終消息中;
(10)2023 SP1的新主題和產(chǎn)品發(fā)布文檔中的一個(gè)條目錯(cuò)誤地說(shuō)明了RCSB結(jié)構(gòu)搜索協(xié)議使用的最新更新的殘基數(shù)據(jù)庫(kù)中的殘基數(shù)量。先前版本部分中的相關(guān)條目已修復(fù),以指示正確的數(shù)字40322;
(11)刪除了在Discovery Studio客戶端中導(dǎo)入?yún)f(xié)議的功能,以解決安全漏洞。您可以使用Pipeline Pilot Professional客戶端將協(xié)議導(dǎo)入服務(wù)器;
(12)Perl腳本示例代碼,MarkSideChainFormationViolations,按預(yù)期在Linux操作系統(tǒng)上的Discovery Studio客戶端上運(yùn)行;
(13)重新啟動(dòng)模擬后,動(dòng)力學(xué)(Production)協(xié)議現(xiàn)在可以正確報(bào)告進(jìn)度;
(14)在MSLD Bias Optimization and Production協(xié)議中,當(dāng)Use BLaDE參數(shù)設(shè)置為False時(shí),可以將“Number of Cores per Simulation”參數(shù)設(shè)置為1;
(15)“打開URL”對(duì)話框中的Discovery Studio客戶端PDB配體默認(rèn)位點(diǎn)定義不再受RCSB支持,并且已從默認(rèn)URL位置首選項(xiàng)中刪除。但是,如果從早期版本的Discovery Studio導(dǎo)入了首選項(xiàng),則此選項(xiàng)仍可能出現(xiàn)。您可以在Edit >Preferences>Files Explorer>“URL位置”頁(yè)面中刪除它們;
(16)Discovery Studio客戶端顯示“增強(qiáng)的采樣”工具面板;
(17)Discovery Studio客戶端中顯示了大分子偶極矩監(jiān)測(cè)器的標(biāo)簽;
關(guān)于北京泰科:
北京泰科博思科技有限公司(Beijing Tech-Box S&T Co. Ltd.)成立于2007年,是國(guó)內(nèi)領(lǐng)先的分子模擬及虛擬仿真綜合解決方案提供商。
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